Dans le contexte inédit de pandémie mondiale de la COVID-19, la diffusion de la COVID-19 en Afrique Sub-Saharienne reste relativement limitée, notamment dans les pays à l’ouest du continent, mais les incertitudes demeurent quant à l’évolution de la pandémie. Dans des contextes nationaux où les pouvoirs publics ne sont pas systématiquement en position d’atténuer substantiellement le choc économique induit par la pandémie, les zones rurales pourraient jouer un rôle majeur d’accueil, comme en ont témoigné les mouvements de populations issues des grandes villes en 2020.

Bien que le Cambodge ait déjà atteint l’objectif des 90-90-90 de l’ONUSIDA (objectif à l'horizon 2020 : 90% des personnes vivant avec le VIH connaissent leur statut sérologique ; 90% de toutes les personnes infectées par le VIH dépistées reçoivent un traitement anti rétroviral durable ; 90% des personnes recevant un traitement antirétroviral ont une charge virale durablement supprimée), dans la population générale, la prévalence du VIH et l’usage non-systématique du préservatif au sein des populations-clés (travailleuses du sexe (TS), hommes ayant des relations sexuelles

En plus du manque d’intégration des services Santé Sexuelle et Reproductive (SSR) et VIH, les programmes nationaux ne s’adaptent pas aux besoins des jeunes. Les actions de promotion sanitaire et de lutte contre le VIH ne ciblent pas les jeunes et encore moins les populations clés. Ce décalage entrave les objectifs de développement durable (ODD), notamment en termes de santé et bien-être, d'égalité entre les sexes, et d'inégalités. Cela favorise un environnement social hostile et pénalise la santé des jeunes concernant la sexualité et la reproduction.

L’infection par le virus de l’hépatite C (VHC) au Cambodge semble particulièrement toucher la population générale âgée de plus de 40 ans en raison d’une transmission nosocomiale avant les années 2000. Cette population est disséminée dans tout le pays mais la faible utilisation du secteur de santé public représente un frein majeur pour identifier les patients présentant une infection active.

L’Afrique Sub-Saharienne est l’une des régions les plus touchées par le virus de l’hépatite B (VHB) et les enfants de moins de 5 ans chez lesquels la prévalence est la plus élevée au monde (3%) sont un groupe particulièrement à risque. Les deux principaux modes de transmission du VHB chez les enfants sont la transmission verticale (transmission mère-enfant) lors de la période périnatale et la transmission horizontale.

D’après les données disponibles, la prévalence de l’infection chronique par le VHB au Sénégal est parmi les plus élevées au monde (entre 10 et 17%). Cependant, ces données sont parcellaires (études menées dans les grandes métropoles, sur des populations à risque ou spécifiques). Aucune étude n’a mesuré l’ampleur de l’infection chronique par le VHB en zone rurale et en population générale, ni ses conséquences sur les conditions de vie des populations.

La raréfaction des ressources humaines et financières internationales met à l'épreuve les structures de santé des pays en développement qui doivent répondre à l'augmentation de la demande tout en préservant la qualité des soins. Dans ce contexte, la pénurie de professionnels de santé est un défi majeur pour les autorités de nombreux pays Africains. L'organisation de leur force de travail est inadaptée car leur stratégie de production de professionnels de santé se base exclusivement sur la demande des soins, ce qui génère des disparités géographiques.

La convergence de populations clés sur les sites d’orpaillage laisse présumer de la forte exposition au risque VIH pour les personnes qui vivent sur ces sites. Le contrat d’initiation Sanu Gundo a montré une prévalence de 8% sur le site de Kokoyo, largement supérieure au 1,1% national. Les taux importants de perdus de vue suggèrent les difficultés expérimentées par le système de santé pour le suivi des personnes vivant avec le VIH (PVVIH).