Les missions de l’ORS s’organisent autour de trois axes, qui bénéficient de financements distincts.
L’ORS développe une activité permanente de centre-ressources régional en observation de la santé à travers l’axe « Observation » principalement cofinancée par l’Agence régionale de santé (ARS) et la Région Sud Provence-Alpes-Côte d’Azur, dans le cadre du contrat de plan Etat-Région ou dans le cadre de conventions spécifiques. Pour la thématique de la santé au travail, ces financements sont complétés par la DREETS et l’Agefiph. Pour l’axe « Recherche », l’ORS réalise des travaux en réponse à des appels à projets (nationaux ou internationaux), qui font l’objet de financements spécifiques. Enfin, pour l’axe « Formations », les financements sont obtenus par les structures qui en font la demande.